Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp8Q80U87 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp8Q80U87 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp8Q80U87 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp8Q80U87 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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