Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims3Q80U57 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims3Q80U57 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms