Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctdp1Q7TSG2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms