Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Shq1Q7TMX5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms