Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcg2Q7TMS5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcg2Q7TMS5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms