Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwistnbQ78WZ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwistnbQ78WZ7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms