Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vma21Q78T54 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vma21Q78T54 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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