Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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