Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Syne2Q6ZWQ0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms