Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Topbp1Q6ZQF0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms