Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms