Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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