Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt9Q6RHW0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt9Q6RHW0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms