Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudcd1Q6PIP5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudcd1Q6PIP5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms