Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NfrkbQ6PIJ4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfrkbQ6PIJ4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms