Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med16Q6PGF3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med16Q6PGF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms