Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HjurpQ6PG16 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HjurpQ6PG16 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms