Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrt3Q6PE13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prrt3Q6PE13 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms