Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SvoplQ6PDF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms