Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trak1Q6PD31 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trak1Q6PD31 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms