Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp2d40Q6P8N9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms