Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpsf6Q6NVF9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms