Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RragbQ6NTA4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RragbQ6NTA4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms