Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sp140Q6NSQ5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms