Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms