Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms