Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Krt77Q6IFZ6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt77Q6IFZ6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms