Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp11bQ6DFW5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms