Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q6DFW0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q6DFW0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms