Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms