Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp4Q68FH0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp4Q68FH0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms