Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spty2d1Q68FG3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms