Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q66JV7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q66JV7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q66JV7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms