Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Polr2kQ63871 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Polr2kQ63871 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms