Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20865Q62460 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20865Q62460 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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