Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sp4Q62445 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sp4Q62445 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms