Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ndufa4Q62425 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ndufa4Q62425 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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