Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RhocQ62159 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhocQ62159 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RhocQ62159 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms