Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npm1Q61937 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms