Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msi1Q61474 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Msi1Q61474 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms