Protein–RNA interactions for Protein: Q61327

Slc6a3, Sodium-dependent dopamine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a3Q61327 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a3Q61327 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms