Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tfap2bQ61313 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tfap2bQ61313 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms