Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms