Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rbbp4Q60972 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms