Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Caprin1Q60865 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Caprin1Q60865 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms