Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms