Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tcf4Q60722 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tcf4Q60722 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms