Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samhd1Q60710 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms