Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClpbQ60649 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms