Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd5Q5VCS6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd5Q5VCS6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms